10 sierpnia 2016 roku Marek Mutor zrezygnował ze stanowiska dyrektora Narodowego Centrum Kultury. Rezygnacja jest motywowana względami osobistymi. Wicepremier, minister kultury i dziedzictwa narodowego prof. Piotr Gliński zamierza ją przyjąć i powierzyć pełnienie obowiązków dyrektora NCK Elizie Dzwonkiewicz, dotychczasowemu zastępcy dyrektora. Jednocześnie minister dziękuje Markowi Mutorowi za dotychczasową dobrą współpracę.
Mutor objął stanowisko dyrektora NCK w lutym br. w związku z koniecznością realizacji pilnych zadań instytucji: organizacji obchodów 1050-lecia Chrztu Polski oraz udziału w przygotowaniach do Światowych Dni Młodzieży. Od lutego do sierpnia Narodowe Centrum Kultury realizowało kilkaset projektów kulturalnych. Ponadto w NCK uporządkowano wiele wewnętrznych procedur instytucji.
Po pomyślnym wykonaniu tych zadań Marek Mutor złożył rezygnację z powodów osobistych. Zamierza wrócić do pracy w Ośrodku „Pamięć i Przyszłość” we Wrocławiu, instytucji wspólnie prowadzonej przez MKiDN oraz samorząd wrocławski, aby realizować projekt budowy sieci instytucji zajmujących się historią ziem zachodnich i północnych oraz rozwijać działalność nowo powstałego Centrum Historii Zajezdnia we Wrocławiu. Równocześnie Marek Mutor pozostaje członkiem ministerialnego zespołu ds. przygotowania obchodów stulecia odzyskania niepodległości.